‘Inflammatory Bowel Disease’ (IBD) is de verzamelnaam voor ontstekingsziektes van het maagdarmkanaal. De belangrijkste typen zijn de ziekte van Crohn en Colitis Ulcerosa. Het belangrijkste verschil tussen de ziekte van Crohn en Colitis Ulcerosa is de locatie en aard van de ontstekingen. Crohn kan voorkomen in elk deel van het maagdarmkanaal (van mond tot anus) hoewel vaak het terminal ileum is aangedaan en juist het rectum minder. Colitis Ulcerosa daarentegen komt alleen maar voor in de dikke darm en het rectum. Onderzoek heeft bewezen dat bacteriën zowel als oorzaak en remedie kunnen fungeren. De ontsteking lijkt zijn oorzaak te vinden in een overmatige immuunreactie op darmbacteriën bij personen die daar (o.a. genetisch) gevoelig voor zijn. Dit leidt dan tot een chronische ontsteking bij deze personen. Pre- en probiotica tonen in toenemende mate hun waarde als behandeling en hebben, in sommige studies en speciale gevallen, bewezen net zo effectief te zijn als farmaceutische producten.